Új csonthéjasokat fertőző vírusok kimutatása Magyarországon

Authors

  • Dániel Baráth Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4.
  • Nikoletta Czotter Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4. https://orcid.org/0000-0002-1524-664X
  • Alexandra Bükki Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4.
  • Beatrix Oláh Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4.
  • Júlia Balássy Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4.
  • Tünde Varga Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4.
  • Luca Szabó Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Gyümölcstermesztési Kutatóintézet, 1223 Budapest, Park utca 2.
  • Tímea Tóth Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Gyümölcstermesztési Kutatóintézet, 1223 Budapest, Park utca 2.
  • Zoltán Kirilla Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Gyümölcstermesztési Kutatóintézet, 1223 Budapest, Park utca 2. https://orcid.org/0009-0003-0100-0547
  • László Kocsis Pannon Egyetem Georgikon Kar, Kertészeti Tanszék, 8360 Keszthely, Deák Ferenc utca 16.
  • Éva Preininger Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Gyümölcstermesztési Kutatóintézet, 1223 Budapest, Park utca 2. https://orcid.org/0009-0006-9072-9808
  • Tamás Lakatos Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Gyümölcstermesztési Kutatóintézet, 1223 Budapest, Park utca 2. https://orcid.org/0000-0003-0405-3532
  • Éva Várallyay Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4. https://orcid.org/0000-0002-9085-942X

Abstract

Orchards can be affected by viral infections, which may have an important role to cause diseases on apricot. With new metagenomic approaches we can prove the presence of all viruses present in the investigated plant, including the ones not described on a particular host, or country yet. Our workgroup has demonstrated the presence of Little Cherry Virus 1 (LChV-1) and Cherry Virus A (CVA) from Hungarian apricot trees with the use of Next-Generation Sequencing (NGS) of small RNAs. Our results were confirmed by RT-PCR, and by Northern blot in the case of CVA. After cloning and Sanger sequencing of viral fragments we investigated their phylogenetic relationships and we determined the spreading of these viruses at different part of Hungary. 

Author Biography

  • Dániel Baráth, Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ, Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4.

    corresponding author
    barath.daniel@abc.naik.hu

References

Barba, M., Czosnek, H., Hadidi, A. 2013. Historical perspective, development and applications of next-generation sequencing in plant virology. Viruses. 6 (1) 106–136. https://doi.org/10.3390/v6010106

Czotter, N., Czakó, K., Várallyay, É., Szegedi, E. 2016. Molekuláris diagnosztikai módszerek a szőlő szaporítóanyaggal terjedő károsítóinak kimutatására, Kertgazdaság 48 (2) 37–44.

Gambino, G., Perrone, I., Gribaudo, I. 2008. A rapid and effective method for RNA extraction from different tissues of grapevine and other woody plants. Phytochemical Analysis. 19 (6) 520–525. https://doi.org/10.1002/pca.1078

Šafářová, D., Faure, C., Candresse, T., Navrátil, M., Nečas, T., Marais, A. 2017. First Report of Little cherry virus 1 Infecting Apricot in the Czech Republic. Plant Disease. 101 (5) 845. https://doi.org/10.1094/PDIS-09-16-1289-PDN

Downloads

Published

2018-03-07

Issue

Vol. 22 No. 1 (2018): Special Issue

Section

Articles

License

Copyright (c) 2018 Baráth Dániel, Czotter Nikoletta, Bükki Alexandra, Oláh Beatrix, Balássy Júlia, Varga Tünde, Szabó Luca, Tóth Tímea, Kirilla Zoltán, Kocsis László, Preininger Éva, Lakatos Tamás, Várallyay Éva

Creative Commons License

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Cikkre a Creative Commons 4.0 standard licenc alábbi típusa vonatkozik: CC-BY-NC-ND-4.0. Ennek értelmében a mű szabadon másolható, terjeszthető, bemutatható és előadható, azonban nem használható fel kereskedelmi célokra (NC), továbbá nem módosítható és nem készíthető belőle átdolgozás, származékos mű (ND). A licenc alapján a szerző vagy a jogosult által meghatározott módon fel kell tüntetni a szerző nevét és a szerzői mű címét (BY). 

How to Cite

Baráth, D., Czotter, N., Bükki, A., Oláh, B., Balássy, J., Varga, T., Szabó, L., Tóth, T., Kirilla, Z., Kocsis, L., Preininger, Éva, Lakatos, T., & Várallyay, Éva. (2018). Új csonthéjasokat fertőző vírusok kimutatása Magyarországon. GEORGIKON FOR AGRICULTURE, 22(1), 28-33. https://journal.uni-mate.hu/index.php/gfa/article/view/6604

Most read articles by the same author(s)