Új csonthéjasokat fertőző vírusok kimutatása Magyarországon
Absztrakt
A gyümölcsfákat fertőző vírusok igen fontos szerepet játszanak a kajszi megbetegítésében. Az egyre gyakrabban használt metagenomikai módszerek az ismert és karantén kórokozókon kívül olyan vírusok kimutatását is lehetővé teszik, melyek jelenléte az adott fajon, vagy adott országban eddig nem volt ismert. Munkacsoportunk egy ilyen metagenomikai módszerrel, a kis RNS-ek újgenerációs szekvenálásával írta le a Little Cherry Virus 1 (LChV-1) és a Cherry Virus A (CVA) vírusokat kajszin, hazánkban. Az így kapott eredményeiket RT-PCR-rel, a CVA esetében Northern blotttal is igazoltuk. A vírusdarabok klónozása és Sanger szekvenálása után a hazai variánsok filogenetikai rokonsági viszonyait, valamint a vírus magyarországi elterjedését is megállapítottuk.
Hivatkozások
Barba, M., Czosnek, H., Hadidi, A. 2013. Historical perspective, development and applications of next-generation sequencing in plant virology. Viruses. 6 (1) 106–136. https://doi.org/10.3390/v6010106
Czotter, N., Czakó, K., Várallyay, É., Szegedi, E. 2016. Molekuláris diagnosztikai módszerek a szőlő szaporítóanyaggal terjedő károsítóinak kimutatására, Kertgazdaság 48 (2) 37–44.
Gambino, G., Perrone, I., Gribaudo, I. 2008. A rapid and effective method for RNA extraction from different tissues of grapevine and other woody plants. Phytochemical Analysis. 19 (6) 520–525. https://doi.org/10.1002/pca.1078
Šafářová, D., Faure, C., Candresse, T., Navrátil, M., Nečas, T., Marais, A. 2017. First Report of Little cherry virus 1 Infecting Apricot in the Czech Republic. Plant Disease. 101 (5) 845. https://doi.org/10.1094/PDIS-09-16-1289-PDN
Letöltések
Megjelent
Folyóirat szám
Rovat
License
Copyright (c) 2018 Baráth Dániel, Czotter Nikoletta, Bükki Alexandra, Oláh Beatrix, Balássy Júlia, Varga Tünde, Szabó Luca, Tóth Tímea, Kirilla Zoltán, Kocsis László, Preininger Éva, Lakatos Tamás, Várallyay Éva

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
The articel is under the Creative Commons 4.0 standard licenc: CC-BY-NC-ND-4.0. Under the following terms: You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. You may not use the material for commercial purposes. If you remix, transform, or build upon the material, you may not distribute the modified material. You may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits.