Ochratoxin a és biodegradációs melléktermékeinek velencei ponty állomány diverzitásának mikroszatellit markerekre alapozott genetikai vizsgálata
DOI:
https://doi.org/10.17205/SZIE.AWETH.2017.2.068Schlagwörter:
mikroszatellit, ponty, diverzitás, genetikaAbstract
Vizsgálatunk során a csak a Velencei tóban fellelhető, mindezidáig elkülönülten fejlődő vadponty (Cyprinus carpio carpio morpha acuminatus) állomány populációgenetikai összetételének elemzését végeztük el, hét mikroszatellit markerrel 36 egyed vizsgálata során. A korábban begyűjtött mintákból genomi DNS-t izoláltunk, elvégeztük (MFW7, MFW6, Cca02, Cca072, Koi41, MFW31, MFW26) a mikroszatellit lókuszok kimutatásához szükséges PCR-reakciókat, majd kapilláris elektroforézis segítségével meghatároztuk az allélok bázispár pontosságú méretét. A mikroszatellit allélok hossza és eloszlása alapján vizsgáltuk az állomány genetikai diverzitását. Az elemzések során meghatároztuk a várt (He) és valós (Ho) heterozigozitást, a populáció Hardy-Weinberg egyensúlytól való eltérését, valamint az egyes markerek adott populációra vonatkozó információs tartalmát (Polymorphic Information Content, PIC). Az alkalmazott markerek többsége magas polimorfitást (PIC) mutatott (MFW6, MFW7 Cca02, Cca072, MFW31, MFW26), alkalmasnak bizonyultak az állomány vizsgálatához. A mikroszatellit vizsgálatok eredménye alapján egyetlen lókusz (Koi41-42) kivételével mindegyik marker esetén szignifikáns eltérést kaptunk a Hardy-Weinberg egyensúlytól. A teljes populációra nézve magasan szignifikáns eltérést kaptunk az egyensúlyi állapottól. A jövőben a genotípusok alapján lehetőségünk nyílik az állomány genetikai diverzitásának növelését célzó, a populáció Hardy-Weinberg egyensúját biztosító keresztezési tervet kidolgozni. Munkákat az Európai Halászati Alap, Halászati Operatív Program III. tengelyének („Európai Halászati Alap: a megújuló halászatért” – az Európai Unió és Magyarország támogatásával) projekt támogatta.
Literaturhinweise
Bakos, J., Gorda, S. (2001): Genetic resources of common carp at the Fish Culture Research Institute, Szarvas, Hungary. FAO Fisheries Technical Paper. No. 417. Rome, FAO. 106 p.
Crooijmans, R., Bierbooms, V. A. F., Komen, J., Vander Poel, J. J., Groenen, M. A. M. (1997): Microsatellite markers in common carp (Cyprinus carpio L.). Anim Genet, 28(2) 129–134. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1997.00097.x
David, L., Rajasekaran, P., Fang, J., Hillel, J., Lavi, U. (2001): Polymorphism in ornamental and common carp strains (Cyprinus carpio L.) as revealed by AFLP analysis and a new set of microsatellite markers. Mol Genet Genom, 266. 353–362. https://doi.org/10.1007/s004380100569
Gorda, S., Borbély, A. (2013): A velencei-tavi vadponty fajta elismerésére irányuló teljesítményvizsgálat eredménye. Összefoglaló jelentés, HAKI és NÉBIH, 18 p.
Horváth, L. (2000): Halbiológia és haltenyésztés; Mezőgazda Kiadó, Budapest
Park, S. D. E. (2001): 'Trypanotolerance in West African Cattle and the Population Genetic Effects of Selection', University of Dublin.
Raymond, M., Rousset, F. (1995): GENEPOP (Version 1.2): Population Genetics Software for Exact Tests and Ecumenicism. Journal of Heredity, 86(3) 248–249. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573
Rousset, F. (2008): 'Genepop’007: a complete re-implementation of the genepop software for Windows and Linux', Molecular Ecology Resources, 8(1) 103–106. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2007.01931.x
Peakall, R., Smouse, P.E. (2012): 'GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update', Bioinformatics, 28(19) 2537–2539. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts460
Smouse, P. E., Whitehead, M. R., Peakall, R. (2015): 'An informational diversity framework, illustrated with sexually deceptive orchids in early stages of speciation', Molecular Ecology Resources, 15(6) 1375–1384. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12422
Szentes, K. (2000): Vadponty (Cyprinus carpio m. accuminatus) a Velencei-tóban. Szakdolgozat, SZIE, Gödöllő, 64 p.
Yue, G. H., Ho, M. Y., Orban, L., Komen, J. (2004): Microsatellites within genes and ESTs of common carp and their applicability in silver crucian carp. Aquaculture 234(1–4) 85–98. https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2003.12.021
Downloads
Veröffentlicht
Ausgabe
Rubrik
Lizenz
Copyright (c) 2017 Keszte Szilvia, Mészáros Orsolya, Kánainé Sipos Dóra, Balogh Erna, Zellei Ágnes, Sebestyén András, Balogh Réka, Guti Csaba Ferenc, Bokor Zoltán, Urbányi Béla, Kovács Balázs
Dieses Werk steht unter der Lizenz Creative Commons Namensnennung - Nicht-kommerziell - Keine Bearbeitungen 4.0 International.
A folyóirat a nyílt hozzáférés elvei szerint működik, cikkeire ugyanakkor a Creative Commons 4.0 standard licenc alábbi típusa vonatkozik: CC-BY-NC-ND-4.0. Ennek értelmében a mű szabadon másolható, terjeszthető, bemutatható és előadható, azonban nem használható fel kereskedelmi célokra (NC), továbbá nem módosítható és nem készíthető belőle átdolgozás, származékos mű (ND). A licenc alapján a szerző vagy a jogosult által meghatározott módon fel kell tüntetni a szerző nevét és a szerzői mű címét (BY).
