Investigation of the causative agent of a virus-like symptom in grapevine
Kulcsszavak:
szőlő vörös foltosodás vírus, GLRaV-1, kis RNS HTS, RT-PCRAbsztrakt
Kutatócsoportunk 2013 óta végez vírusdiagnosztikai felméréseket szőlőültetvényekben egy új módszer, a kis RNS HTS használatával. 2018-ban egy Pinot noir ültetvényen furcsa, a szőlő vörös foltosodás vírus (GRBaV) jelenlétére utaló tüneteket figyeltek meg. A vírust 2013-ban Kaliforniában írták le, elterjedése az EPPO nyilvántartása szerint 2 kivételtől eltekintve (India és Dél-Korea) az észak-amerikai földrészre korlátozódik. A tünetek okainak felderítésére a jellemző tüneteket mutató szőlők RNS-éből kis RNS szekvenálással végeztünk vírusdiagnosztikát. A kapott eredményeket egy független módszerrel, RT-PCR-rel igazoltuk. Eredményeink azt mutatják, hogy a sajátos tünetek kialakulásában nem a feltételezett vírus játszott szerepet, a GRBaV nincs jelen a vizsgált ültetvényen. Az ültetvény viszont több vírussal is fertőzött volt. A tünetek kialakulásának az oka ez esetben a különböző vírusok együttes fertőzésében, az ültetvény talajának inhomogenitásában keresendő, de pontos megállapításához további vizsgálatok szükségesek
Hivatkozások
Blanco-Ulate, B., Hopfer, H., Figueroa-Balderas, R., Ye, Z., Rivero, R. M., Albacete, A., et al. 2017. Red blotch disease alters grape berry development and metabolism by interfering with the transcriptional and hormonal regulation of ripening. Journal of Experimental Botany. 68. 1225–1238. https://doi.org/10.1093/jxb/erw506
Cieniewicz, E. J., Pethybridge, S. J., Gorny, A., Madden, L. V., McLane, H., Perry, K. L., et al. 2017. Spatiotemporal spread of grapevine red blotch-associated virus in a California vineyard. Virus Research. 241. 156–162. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2017.03.020
Czotter, N., Molnár, J., Pesti, R., Demián, E., Baráth, D., Varga, T., et al. 2018a. Use of siRNAs for Diagnosis of Viruses Associated to Woody Plants in Nurseries and Stock Collections. In: Viral Metagenomics: Methods and Protocols. (Pantaleo, V. and Chiumenti, M., eds.). New York, NY: Springer New York, pp. 115–130. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7683-6_9
Czotter, N., Molnar, J., Szabo, E., Demian, E., Kontra, L., Baksa, I., et al. 2018b. NGS of Virus- Derived Small RNAs as a Diagnostic Method Used to Determine Viromes of Hungarian Vineyards. Frontiers in Microbiology. 9. 122. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.00122
Pooggin, M. M. 2018. Small RNA-Omics for Plant Virus Identification, Virome Reconstruction, and Antiviral Defense Characterization. Frontiers in Microbiology. 9. 2779. https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02779
Rwahnih, M. A., Dave, A., Anderson, M. M., Rowhani, A., Uyemoto, J. K., Sudarshana, M. R. 2013. Association of a DNA Virus with Grapevines Affected by Red Blotch Disease in California. Phytopathology. 103. 1069–1076. https://doi.org/10.1094/PHYTO-10-12-0253-R
Sudarshana, M. R., Perry, K. L., Fuchs, M. F. 2015. Grapevine Red Blotch-Associated Virus, an Emerging Threat to the Grapevine Industry. Phytopathology. 105. 1026–1032. https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-14-0369-FI
Yepes, L. M., Cieniewicz, E., Krenz, B., McLane, H., Thompson, J. R., Perry, K. L., et al. 2018. Causative Role of Grapevine Red Blotch Virus in Red Blotch Disease. Phytopathology. 108. 902–909. https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-17-0419-R
Letöltések
Megjelent
Folyóirat szám
Rovat
License
Copyright (c) 2021 Dana Khrais, Demián Emese, Várallyay Éva
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
The articel is under the Creative Commons 4.0 standard licenc: CC-BY-NC-ND-4.0. Under the following terms: You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. You may not use the material for commercial purposes. If you remix, transform, or build upon the material, you may not distribute the modified material. You may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits.