A mitokondrium és a kloroplaszt modellezésének összehasonlító elemzése és tanulságai

Szerzők

  • Varga Mónika Kaposvári Egyetem, Informatika Tanszék, 7400 Kaposvár, Guba S. u. 40.

Kulcsszavak:

folyamatmodellezés, sejtfolyamatok, mitokondrium, kloroplaszt, hálózat és háló elemzés

Absztrakt

Munkámban egyszerűsített folyamat modell segítségével tanulmányoztam a kloroplaszt és a mitokondrium működésének hasonló illetve eltérő strukturális és funkcionális jellegzetességeit, különös tekintettel a mitokondriális membránhoz, illetve a tylakoid membránhoz kapcsolódó proton és elektron transzporttal kísért folyamatokra, valamint a két kompartment környezeti kapcsolataira. A mitokondriális membrán energiatermelő folyamatának lényege az, hogy a szerves anyag CO2 képződéssel járó lebontása során NADH + H+ illetve FADH2 formában elvont protonokat és elektronokat O2 felhasználásával vízzé oxidálja, egyúttal protonáramlással működteti az ADP-ből ATP-t előállító fehérje gépezetet. A tylakoid membrán energiahasznosító folyamatának lényege az, hogy fényenergia felhasználásával a vizet O2-re, valamint protonokra és elektronokra bontja és NADPH + H+ formájában hidrogént szolgáltat a CO2 beépítésével járó szerves anyag szintézishez, egyúttal protonáramlással működteti az ADP-ből ATP-t előállító fehérje gépezetet. A kloroplaszt strómája egyetlen reakcióval kapcsolódik a Calvin ciklushoz, és a környezeti kapcsolatok az NADP, NADPH + H+, ATP és ADP tároláson keresztül realizálódnak. A mitokondrium belső tere viszont lényegében magában foglalja a teljes Szent-Györgyi ciklust. A mitokondrium és a kloroplaszt membránfolyamatainak lényeget kiemelő, strukturális modelljeit összehasonlítva megállapítottam, hogy a két membránfolyamat legfontosabb fluxusait meghatározó hálózat egyetlen gráfél kivételével csak a gráfélek ellentétes irányításában különbözik egymástól. A többlet gráfél a kloroplasztban egy további elektronkör kialakulását biztosítja. A két ellentett hálózatban az ATP előállító fehérjegép is „fordítva van bekötve”, ezért mindkét esetben ATP-t termel.

Információk a szerzőről

  • Varga Mónika, Kaposvári Egyetem, Informatika Tanszék, 7400 Kaposvár, Guba S. u. 40.

    varga@matinf.gtk.u-kaposvar.hu

Hivatkozások

Wikswo, J. P., Prokop, A., Baudenbacher, F., Cliffel, D., Csukas, B., Velkovsky M. (2006): The Engineering Challenges of BioNEMS: The Integration of Microfluidics, and Micro- and Nanodevices, Models, and External Control for System Biology. IEE Proc. Nanobiotechnology, 153(4), 81–101.

NIH pályázat (2006): Tools for Metabolomics: Experiments, Models and Analysis. A Vanderbilt University és a Kaposvári Egyetem együttműködésében készített NIH pályázat kézirata

Varga M. (2006): Egy nagyobb méretű metabolikus modell kifejlesztése. Modell leírás és előzetes eredmények. Acta Agraria Kaposváriensis, 10(3), 153–161.

Varga N., Klojbert R. (2007): Lépések a mesterséges kloroplaszt alapú hidrogén termelés megvalósítása felé egy új számítógépi szimulációs módszer alkalmazásával. 16. Ifjúsági Tudományos és Innovációs Tehetségkutató Verseny

Letöltések

Megjelent

2007-07-15

Hogyan kell idézni

Varga, M. (2007). A mitokondrium és a kloroplaszt modellezésének összehasonlító elemzése és tanulságai. Acta Agraria Kaposváriensis, 11(2), 249-258. https://journal.uni-mate.hu/index.php/aak/article/view/1886

Ugyanannak a szerző(k)nek a legtöbbet olvasott cikkei