Solanaceae családba tartozó gyomok viromjának vizsgálata

Szerzők

  • Burim Ismajli Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Pathology, Genomics Research Group
  • Pásztor György Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Protection https://orcid.org/0009-0007-8241-0087
  • Takács András Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Protection https://orcid.org/0009-0000-8149-8581
  • Várallyay Éva Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Pathology, Genomics Research Group https://orcid.org/0000-0002-9085-942X

Kulcsszavak:

vírusdiagnosztika, Solanaceae, endemikus növények, invazív gyomok, uborka mozaik virus, széles babsorvadás virus, PCR, RT-PCR, HTS, virus rezervoár

Absztrakt

Kutatásunk során a szántóföldek szélén és természetes élőhelyeken található Solanaceae családba tartozó két gyomnövény faj viromját vizsgáltuk. Kísérleteinkhez 2022-ben Keszthely közelében két különböző helyszínen gyűjtöttünk levélmintát vírusfertőzés tüneteit mutató Datura stramonium és Solanum nigrum növényekről. Kis RNS-ek és RNS-ek nagy áteresztőképességű szekvenálását (HTS) végeztük el, és a szekvenált olvasatokat bioinformatikai módszerekkel elemeztük. Az azonosított vírusok közül RT-PCR segítségével igazoltuk az uborkamozaikvírus háromosztatú genomjának mindhárom RNS-ét, valamint a széles babhervadás vírus 1 (BBWV1) RNS2 jelenlétét. A HTS a minták több más vírussal való fertőzését is mutatta, amelyek jelenlétének igazolása jelenleg folyamatban van. Eredményeink hozzájárulnak a Solanaceae növényeket fertőző vírusok változatosságának azonosításához és megértéséhez, és rávilágítanak e növények vírusrezervoárként betöltött szerepére, így segíthetik az endemikus és invazív növénypopulációk vírusfertőzöttségének megelőzését szolgáló stratégiák kidolgozását.

Szerző életrajzok

  • Burim Ismajli, Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Pathology, Genomics Research Group

    levelezőszerző
    ismajli.burim@phd.uni-mate.hu

  • Pásztor György, Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Protection

    pasztor.gyorgy@uni-mate.hu

  • Takács András, Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Protection

    takacs.andras.peter@uni-mate.hu

  • Várallyay Éva, Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Institute of Plant Protection, Department of Plant Pathology, Genomics Research Group

    varallyay.eva@uni-mate.hu

Hivatkozások

Duffus, J. E. 1971. Role of weeds in the incidence of virus diseases. Annual Review of Phytopathology. 9 (1) 319–340. https://doi.org/10.1146/annurev.py.09.090171.001535

Gebhardt, C. 2016. The historical role of species from the Solanaceae plant family in genetic research. Theoretical and Applied Genetics. 129 (12) 2281-2294. https://doi.org/10.1007/s00122-016-2804-1

Hančinský, R., Mihálik, D., Mrkvová, M., Candresse, T. and Glasa, M. 2020. Plant viruses infecting Solanaceae family members in the cultivated and wild environments: A Review. Plants. 9 (5) 667. https://doi.org/10.3390/plants9050667

Olmstead, R.G., Bohs, L., Migid, H. A., Santiago-Valentin, E., Garcia, V. F. and Collier, S.M. 2008. A molecular phylogeny of the Solanaceae. Taxon. 57 (4) 1159–1181. https://doi.org/10.1002/tax.574010

Takács A., Horváth J. és Kazinczi G. 2006. Burgonya ökoszisztémában előforduló Solanum nigrum és Datura stramonium vírusrezervoár szerepének vizsgálata, XVI Növényvéd. Fórum, Keszthely 103.

Takács, A. P., Kazinczi, G., Horváth, J. and Pribék, D. 2001. New host-virus relations between different Solanum species and viruses. Meded. Rijksuniv. Gent Fak Landbouwkd Toegep Biol. Wet. 66 (2a) 183–186.

Wren, J. D., Roossinck, M. J., Nelson, R. S., Scheets, K., Palmer, M. W. and Melcher, U. 2006. Plant Virus Biodiversity and Ecology. PLOS Biology. 4 (3) 80. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0040080

Letöltések

Megjelent

2024-02-29